Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcf1Q6P542 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcf1Q6P542 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf1Q6P542 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms