Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2aQ6P4T0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2aQ6P4T0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms