Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Soga3Q6NZL0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Soga3Q6NZL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Soga3Q6NZL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Soga3Q6NZL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms