Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rprd2Q6NXI6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms