Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2surpQ6NV83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2surpQ6NV83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2surpQ6NV83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms