Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nomo1Q6GQT9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nomo1Q6GQT9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms