Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd2Q6DVA0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd2Q6DVA0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd2Q6DVA0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms