Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc3c1Q6DFV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms