Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nlrp9aQ66X03 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrp9aQ66X03 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp9aQ66X03 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp9aQ66X03 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms