Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CilpQ66K08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CilpQ66K08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms