Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna3Q65CL1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms