Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2a3Q64518 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2a3Q64518 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms