Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CochQ62507 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CochQ62507 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CochQ62507 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CochQ62507 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CochQ62507 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CochQ62507 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CochQ62507 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CochQ62507 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CochQ62507 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CochQ62507 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CochQ62507 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CochQ62507 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CochQ62507 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CochQ62507 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CochQ62507 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CochQ62507 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CochQ62507 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CochQ62507 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CochQ62507 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CochQ62507 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CochQ62507 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CochQ62507 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CochQ62507 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CochQ62507 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CochQ62507 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CochQ62507 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CochQ62507 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms