Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps72Q62481 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps72Q62481 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms