Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vat1Q62465 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms