Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox19Q62249 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox19Q62249 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms