Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccne1Q61457 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccne1Q61457 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccne1Q61457 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms