Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccna1Q61456 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccna1Q61456 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms