Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde3bQ61409 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde3bQ61409 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms