Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsg101Q61187 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsg101Q61187 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms