Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamb3Q61087 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lamb3Q61087 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms