Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TmpoQ61033 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TmpoQ61033 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TmpoQ61033 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TmpoQ61033 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TmpoQ61033 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TmpoQ61033 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms