Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kpna1Q60960 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna1Q60960 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna1Q60960 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna1Q60960 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms