Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Neurod1Q60867 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Neurod1Q60867 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Neurod1Q60867 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms