Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp1r1bQ60829 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp1r1bQ60829 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp1r1bQ60829 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms