Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SkiQ60698 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SkiQ60698 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SkiQ60698 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms