Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd4Q60688 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms