Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChukQ60680 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChukQ60680 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChukQ60680 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChukQ60680 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChukQ60680 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChukQ60680 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChukQ60680 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms