Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uimc1Q5U5Q9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uimc1Q5U5Q9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms