Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a6Q5U4D8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc5a6Q5U4D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc5a6Q5U4D8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms