Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdcp1Q5U462 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdcp1Q5U462 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms