Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d9bQ5SVR0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tbc1d9bQ5SVR0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms