Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms