Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TefmQ5SSK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TefmQ5SSK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms