Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf215Q5SPX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf215Q5SPX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms