Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ecm2Q5FW85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ecm2Q5FW85 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ecm2Q5FW85 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms