Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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