Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox3aQ4TU90 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox3aQ4TU90 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms