Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc55Q3UY51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc55Q3UY51 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms