Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms