Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Slfn4Q3UV66 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slfn4Q3UV66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn4Q3UV66 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms