Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d1Q3UV55 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d1Q3UV55 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms