Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elf3Q3UPW2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elf3Q3UPW2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elf3Q3UPW2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms