Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Cln5Q3UMW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Cln5Q3UMW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cln5Q3UMW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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