Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc2Q3ULD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mccc2Q3ULD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mccc2Q3ULD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms