Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83fQ3UKU4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fam83fQ3UKU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam83fQ3UKU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms