Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp19Q3UJD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp19Q3UJD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp19Q3UJD6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms