Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Dtx3lQ3UIR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dtx3lQ3UIR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dtx3lQ3UIR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms