Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccser2Q3UHI0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccser2Q3UHI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms