Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brms1lQ3U1T3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brms1lQ3U1T3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1lQ3U1T3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms